8月初，京都所司代稻叶正邦发动政变，率武士冲入京都御所要求睦仁退位，在曰本国成立德川将军为元首的武家国度。但随后其就被会津藩松平家剿灭，激斗中，京都化作一片熊熊火海，稻叶正邦也毙命于大火中。
稻叶正邦叛乱据说是因为其目睹武家社会一步步走向崩溃而绝望，如此才作出了反常的行为，其并没有得到幕府的支持。
因为将其剿灭，负有王城守护者之名的会津藩，一直以来便是幕府之亲藩，也就是与德川家有血缘关系的藩领，会津藩可以说是防范奥羽诸多外样大名的前线，地位极为重要，而几年前，又被幕府授予护卫京都之重任。
会津家训十五条，其中规定：会津藩便是将军家的守护神，藩主与家臣永不可背叛德川的天下。这一家训，自问世起就被会津松平家上下一力坚守，号称“会津魂”。
既然没有得到将军的首肯，稻叶正邦为何敢于冲击京都御所，而因为稻叶正邦的毙命，此事便也成为幕末时代难解谜团之一。有人说其是将军秘密授意，但又因为支持将军统一曰本国的英国人出尔反尔，态度暧昧，将军才不得不急刹车，稻叶正邦不过是将军的替死鬼。也有人说，这里面有中国人参与。不过不管何等说法，都难以自圆其说，都有无数条理由可以驳斥。
话说回来，幕末时代，曰本国内思想对立尖锐，稻叶正邦只不过是被后世称为“最后的武士”、“绝望的挣扎者”中之一员，如同稻叶正邦这样的疯子又何止一人内忧外患，遇千年未有之大变局，这些被各种思想折磨的姓格悲观扭曲的武家，行事实在已经不能以常理推测。
此事对于皇室声望的打击可想而知，近千年幕府统治下的曰本，天皇本就是玩具般被大名们抢夺，号称是神，但与明治之后曰本皇室利用神道教进行敬神爱国、崇祖忠皇教育的氛围完全不同，其皇室的皇权、威望更远远不及后世。
京都“禁门之变”使得上京的八百二十九町中一百七十六町被烧毁，二万四千五百七十四间
