十一月二日，京城保卫战大幕拉开后的第四天，继西直门明军苦战一晚击退鞑子的进攻后，朝阳门、崇文门、安定门相继遭到鞑子进攻。
在这四天里，鞑子将京师周边的兴州中屯卫和后屯位，营州左、右、中、后、前五卫，定边卫和神武中卫等卫城悉数攻取，主要是这些地方的兵马已抽调到京城，只留有少数官兵留守，鞑子发起攻城后基本没遭遇多少抵抗。
除此之外，京师周边的房山、良乡、通州、顺义、昌平等县城都受到鞑子兵马滋扰，好在军民一心，鞑子发现一时间难以攻取后，便采取威慑的态度，不时派马队在这些城池旁疾驰而过，使得各县城都不敢派兵出城。
如此一来，京师实际上陷入孤立无援的状态，鞑靼汗部兵马，这个时候才在达延汗巴图蒙克的率领下，进驻京师南面的南苑。
此番蒙古各部进犯大明京城的总兵力高达十万，但由于京师城池太大，仍无法形成全面而彻底的包围圈，京城共九门，鞑靼兵马分成十军，其中九军各自面对大明一座城门，此外便是达延汗巴图蒙克亲率的驻在南苑的中军，可集中兵马挥师进攻任何一座城门。
进入冬月，京城乱成了一锅粥，官员和百姓中有不少人都想逃离这个是非之地，但京城戒严已久，如今随着鞑子围城检查更加严密，没有皇帝旨意谁都无法出城，所有人都只能无奈地在城中等待战事结束。
由于鞑子围困，朝廷政务陷入瘫痪，中枢命令无法传递出京，地方有什么事情也无法传送到朝廷，京城最要害的衙门，便是刚成立的总理军务衙门，这衙门并非皇帝钦命委派，而是内阁擅自做主设立。
总理军务衙门负责人为熊绣，之前皇帝任命的顾问大臣都在这个衙门当差，京城所有事情，无论涉及军政还是民政，政令一律出自总理军务衙门。
大明并无宰相，然而在设立总理军务衙门后，首辅刘健的权力已经与宰相无异，行使行政和军事最高统辖权，甚至可以代天子行事。之前政令尚需通过太子
