相当大的关系，也曾经多次被埃及统治。
由于穆罕默德·阿里将苏丹视为一个相当有价值的新领地。在他本人及继承者统治期间，埃及与苏丹成为一个单一政治实体，其后所有王朝的统治者都致力于维护这个尼罗河谷的联合。此政策在阿里的孙子伊斯梅尔帕夏在位期间，更被进一步强化。
后来英国入侵埃及，和埃及签订了英埃共管苏丹条约，条约当中，埃及只是名义上的管理者。但只要英埃共管苏丹条约还在，埃及就有理由自古以来。
“尼罗河的安危对埃及而言是灭顶之灾，只要控制住上游的苏丹和友善的埃塞俄比亚。就能在水源上让埃及不要轻举妄动。”
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